善良的女秘书在第二季中，那须田步（冈田 饰）和九鬼静（中井 饰）这对搭档，在“工作方式改革”的浪潮席卷下，降临到了越来越混乱的日本医疗界。除了医生的短缺，医生和护士的加班时间也受到很大的限制，在不断缩小的生命现场，挑战新的战斗。